Home > Microbiology & Humanities Sciences > Database > MST Mycobacterium avium

Microbiology & Humanities Sciences

MST Mycobacterium avium

GenotypeSpacerSpecies 
MAC2MAC4MAC15MAC16 .....................................................
1 1 1 1 1 M. avium subsp. silvaticum
2 1 2 1 2 M. avium subsp. avium
3 2 3 1 2 M. avium subsp. avium
4 1 1 1 2 M. avium subsp. avium
5 3 3 1 2 M. avium subsp. avium
6 4 4 2 3 M. avium subsp. paratuberculosis. C
7 5 4 2 3 M. avium subsp. paratuberculosis. S
8 6 4 2 4 M. avium subsp. paratuberculosis. S
9 6 5 2 4 M. avium subsp. paratuberculosis. S
10 1 6 3 5 M. avium subsp. paratuberculosis
11 7 7 4 6 M. avium subsp. paratuberculosis
12 1 8 1 7 M. avium subsp. hominissuis
13 1 8 1 8 M. avium subsp. hominissuis
14 8 8 5 6 M. avium subsp. hominissuis
15 1 9 1 8 M. avium subsp. hominissuis
16 1 10 1 9 M. avium subsp. hominissuis
17 1 11 6 10 M. avium subsp. hominissuis
18 9 11 6 10 M. avium subsp. hominissuis
19 1 12 7 8 M. avium subsp. hominissuis
20 10 13 4 6 M. avium subsp. hominissuis
21 11 12 4 11 M. avium subsp. hominissuis
22 1 13 1 7 M. avium subsp. hominissuis
23 1 14 8 6 M. avium subsp. hominissuis
24 1 9 1 12 M. avium subsp. hominissuis
25 1 8 1 13 M. avium subsp. hominissuis
26 1 9 1 7 M. avium subsp. hominissuis
27 10 13 9 6 M. avium subsp. hominissuis
28 1 10 1 7 M. avium subsp. hominissuis
29 1 15 1 7 M. avium subsp. hominissuis
30 1 8 1 12 M. avium subsp. hominissuis
31 1 12 4 8 M. avium subsp. hominissuis
32 11 12 1 8 M. avium subsp. hominissuis
33 12 16 10 14 M. colombiense
34 13 17 11 15 M. colombiense
35 14 18 12 16 M. chimaera
36 15 19 12 17 M. chimaera
37 16 20 13 18 M. intracellulare
38 17 20 13 19 M. intracellulare
39 8 20 13 20 M. intracellulare
40 18 21 13 17 M. intracellulare
41 14 20 14 16 M. intracellulare
42 19 22 15 21 M. intracellulare
43 20 20 16 17 M. intracellulare
44 21 23 17 22 M. massiliense
45 22 24 18 23 M. timonense
46 23 25 19 24 M. bouchedurhonense
47 24     25 M. arosiense
48 1 12 1 6 M. avium subsp. hominissuis
49 25 26 20 26 M. intracellulare./ M. chimaera
50 3 10 8 7 M. avium subsp. hominissuis
51 10 8 1 8 M. avium subsp. hominissuis
52 1 8 1 6 M. avium subsp. hominissuis
53 1 20 13 12 M. avium subsp. hominissuis
54 11 12 4 8 M. avium subsp. hominissuis
55 17 20 16 18 M. chimaera
56 1 20 13 19 M. intracellulare
57   1 1 7 M. avium subsp. hominissuis
58 10 13 4 7 M. avium subsp. hominissuis
59   new new new  
60 1 6 1 8 M. avium subsp. avium
61 13 20 11 15  
62 12 16 10 16 M. colombiense
63 16 20 10 19 M. intracellulare
64 1 20 13 12 M. intracellulare
65   12 1 10 M. avium subsp. hominissuis
66 1 19 8 7 M. avium subsp. hominissuis
67 16 21 13 18 M. indicus pranii
69 1 8 1 11 M. avium subsp. hominissuis
70 11 12 4 7 M. avium subsp. hominissuis
72 7 6 3 5 M. avium subsp. avium
73 16 20 13 19 M. intracellulare
72 1 8 11 14 M. avium subsp. hominissuis
73 17 20 13 19 M. intracellulare
74 10 1 4 6 M. avium subsp. hominissuis
75 16 20 13 16 M. intracellulare
76 1 8 4 11 M. avium subsp. hominissuis
77 7 12 4 8 M. avium subsp. hominissuis
78 1 13 4 12 M. avium subsp. hominissuis
79 16 21 16 18 M. intracellulare
80 16 20 16 19 M. intracellulare
81 14 18 15 16 M. intracellulare

 

Référence:

Genotyping of Mycobacterium avium complex organisms using multispacer sequence typing.
Cayrou C, Turenne C, Behr MA, Drancourt M.
Microbiology. 2010 Mar;156(Pt 3):687-94. doi: 10.1099/mic.0.033522-0. Epub 2009 Nov 19.
PMID: 19926652

papier


© IHU Méditerranée Infection - Contact / Site map / Credit